La opción "Gestionar proyectos" del menú situado en la barra superior izquierda, nos permite mantener colecciones de referencias separadas para diferentes proyectos de investigación.
Desde esta opción podemos: crear un nuevo proyecto, renombrarlo, compartirlo, eliminarlo o mantenerlo como proyecto en curso.
Cuando tenemos varios proyectos creados en nuestra cuenta de RefWorks, cada vez que exportemos referencias tendremos que elegir en cuál de ellos queremos guardarlas. También podremos elegir la carpeta.
Además, cuando queramos insertar citas en un documento Word con el complemento RCM, tendremos que elegir el proyecto dentro del cual se encuentran las referencias que queremos citar.
Dentro de cada proyecto tendremos nuestras referencias organizadas en carpetas.
Hay que tener en cuenta que RefWorks no permite exportar referencias bibliográficas desde un proyecto a otro.